A continuación se presenta una lista de los herbarios con perfil de colección en el portal y que actualmente comparten datos de sus ejemplares botánicos.
- Herbario CFNL de la Universidad Autónoma de Nuevo León
- Herbario de la Universidad Autónoma de Nayarit UAN-HUAN)
- Herbario del Centro de Investigaciones Tropicales de la Universidad Veracruzana (CITRO)
- Herbario del Centro Universitario de la Costa, Universidad de Guadalajara (PV)
- Herbario Regional de Sinaloa (HERSIN)
- Herbario «Luz María Villarreal de Puga» de la Universidad de Guadalajara (IBUG)
- Herbario Alfredo Barrera Marín (UADY)
- Herbario Annetta Mary Carter (HCIB)
- Herbario de la Unidad Regional Universitaria de Zonas Áridas (URUZA)
- Herbario de la Universidad Autónoma de Baja California (BCMEX)
- Herbario de la Universidad de Colima (UCOL)
- Herbario de la Universidad de Sonora (USON)
- Herbario del Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C. (HCIAD)
- Herbario del Estado de Zacatecas
- Herbario del Jardín Botánico BUAP
- Herbario del Jardín Botánico Culiacán (HJBC)
- Herbario Isidro Palacios (SLPM)
- Herbario Jerzy Rzedowski (QMEX)
- Herbario Jorge Arturo Alba Avila (HJAAA)
- Herbario Mtra. Graciela Calderón Díaz-Barriga y Dr. Jerzy Rzedowski (IPN-CIIDIR)
- Herbario Walter L. Meagher, Jardín Botánico El Charco del Ingenio (WLM)
- Herbario de la Universidad Autónoma Chapingo (CHAP)
- Herbario-Hortorio CHAPA, Colegio de Posgraduados (CHAPA)
- Herbario de la Universidad Autónoma de Campeche (UACAM)
- Herbario Eizi Matuda, UNICACH (HEM)
- Herbario del Orquidario y Jardín Botánico de Comitán (HOJBC)